精子畸形率99%可以考虑做试管婴儿。

试管婴儿是指把精子和卵子提取出来，用特殊的方法将其在体外结合形成受精卵，然后植入女方子宫内，为夫妻双方提供生育健康孩子的机会。对于精子畸形率99%的情况，通过代生及费用方面的考量，试管婴儿是可行的选择。试管婴儿的成功率较高，可以达到40%~60%，但是需要多种条件才能够成功，健康有活力的精子是一个重要前提。一般来说，部分精子畸形也可以怀孕成功。但是，如果精子畸形率超过96%，就属于畸形精子症，通过自然受孕的概率大幅下降，也可以通过辅助生殖技术比如试管婴儿实现怀孕目的，进行助孕咨询是明智的第一步。

对于精子畸形率99%的患者，可以对精液进行实验室处理，通过离心、梯度离心的方式，或者采取胞浆内形态学筛选精子注射技术进行精子筛选，优选成熟的、具有受精潜能活动的优质精子进行受孕，从而可提高受精率、着床率和妊娠率以及降低流产率。即使是代生二胎的需求，这项技术也能提供希望。